朱镕基在会晤中讲话指出，“上海合作组织”的成立正在对当今国际和地区的局势产生重要而深远的影响。首次总理会晤的任务就是要具体落实上海峰会的决议和精神。六国已在政治、安全和外交等领域开展了卓有成效的合作，建立了会晤和磋商机制。就健全“上海合作组织”的运行机制而言，当前应重点抓好两项工作：一是尽快着手制定《上海合作组织宪章》，以做到有章可循，有法可依；二是抓紧建立比什凯克反恐怖中心，以使我们在联合打击恐怖主义、分裂主义和极端主义的行动中，既有法律基础，更有操作手段。

　 朱镕基强调，在开展区域经济合作方面，要优先启动贸易投资便利化进程，制定多边经贸合作纲要的倡议。这有利于密切各方的经济联系，使“上海合作组织”始终保持蓬勃发展的活力，也有利于我们参与全球经济合作与竞争，提升本国和本地区在世界政治、经济格局中的地位。

　 朱镕基还就深入开展六国区域经济合作，提出了几点意见：一、坚持平等互利原则。二、遵循市场经济规则。三、循序渐进，注重实效。四、多边与双边相结合。

　 六国总理在充满相互理解、建设性和友好的气氛中全面讨论了“上海合作组织”发展和六国经贸合作问题，并就开展经贸、交通运输、能源、农业、环保、金融、水资源利用、防止森林火灾等各个领域的合作表达了各国的关切。六国总理一致认为，发展“上海合作组织”框架内的长期稳定的友好合作符合六国和六国人民的根本利益，有利于推动六国关系迈上新的层次和水平。

　 六国总理在会晤中一致决定启动六国多边经贸合作进程，签署了《“上海合作组织”成员国政府间关于开展区域经济合作的基本目标和方向及启动贸易和投资便利化进程的备忘录》；宣布正式建立“上海合作组织”框架内的总理定期会晤机制，并发表了《“上海合作组织”成员国政府总理第一次会晤新闻公报》。六国总理还发表了《“上海合作组织”成员国政府总理声明》，对美国11日发生的恐怖行动表示极其愤慨，向美国人民及受害者表示慰问和同情，并表示“上海合作组织”准备同所有国家和国际组织密切配合，采取有效措施，为根除恐怖主义带来的全球性危险而进行毫不妥协的斗争。