条例共5章39条，包括总则、棉花质量义务、棉花质量监督、罚则，附则。制定本条例是为了加强棉花质量的监督管理，维护棉花市场秩序，保护棉花交易各方的合法权益。

　 条例强调，严禁棉花经营者在收购、加工、销售、承储等棉花经营活动中掺杂掺假、以次充好、以假充真。如违反此规定，构成犯罪的，依法追究刑事责任；尚不构成犯罪的，由棉花质量监督机构没收掺杂掺假、以次充好、以假充真的棉花和违法所得，并处违法货值金额2倍以上5倍以下的罚款；同时移送工商行政管理机关依法吊销营业执照。

　 条例还规定，国家实行棉花质量公证检验制度。由专业纤维检验机构按照国家标准和技术规范，对棉花质量、数量进行检验并出具公证检验证书，公证检验不得收取任何费用，所需费用按国家有关规定列支。