《旗帜》由“红色足迹”、“共产党人”和“世纪跨越”三大板块构成。这三部分分别围绕中国共产党的奋斗历史、共产党人的风采以及改革开放以来中国各项事业所取得的成就展开。整个特别节目由大型现场直播、大型演播室报道、演播室谈话节目、大型专题文艺晚会、人物访谈和多种形式的专题节目等构成。